Sylwetki absolwentów Wydziału Nauk Biologicznych UWr:

mgr Mateusz Dróżdż- doktorant w Freie Universitat Berlin

Projekt studiów doktoranckich: „Alternatywny splicing genów wczesnej odpowiedzi komórkowej po aktywacji limfocytów jest kontrolowany przez hnRNPC”

Ekspresja genów wczesnej odpowiedzi komórkowej (ang. „Immediate early genes (IEGs)”) jest przejściowo indukowana pod wpływem stymulacji komórkowej; regulacja ta jest niezależna od syntezy białek. Ekspresja IEGs zależy od kaskad fosforylacji ukierunkowanych na maszynerię transkrypcyjną. W niniejszym projekcie wykazano, że podobne kaskady sygnalizacyjne mogą być również wynikiem maszynerii splicingowej; proces ten nazwano „Immediate Early Splicing” (IES).

Na podstawie wyników sekwencjonowania RNA znaleziono IES w początkowych stadiach aktywacji limfocytów. Zmiana alternatywnego splicingu wynika z retencji intronów genów kodujących białka rybosomalne i czynniki inicjacji translacji. IES wymaga fosforylacji hnRNPC2 – głównego regulatora splicingu, którego kinetyka jest wysoce zbliżona do kinetyki splicingu i ,podobnie jak ekspresja IEG, jest kontrolowana przez szlak transdukcji sygnału RAF-MEK-ERK. Ponadto, zaobserwowano ekspresję IES tylko w limfocytach, co świadczy o udziale dodatkowej kinazy specyficznej dla tych komórek – PKCtheta. Izoformy białek rybosomalnych z retencją intronów biorą udział we wczesnej redukcji translacji białek, co ma związek z prawidłowym wydatkowaniem energii podczas aktywacji limfocytów.

Projekt obejmuje zagadnienia z dziedziny fizjologii komórki, genetyki, i biochemii (m.in. badania mechanizmów komórkowych in vitro, analiza EMSA (ang. electrophoretic mobility shift assay), PCR, Western-Blot, klonowanie genów).